RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	FOXF1	Q12946	379 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	RIN1	Q13671	783 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	GABRA6	Q16445	453 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	CARM1	Q86X55	608 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	METTL4	Q8N3J2	472 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	TEX29	Q8N6K0	151 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	WDR31	Q8NA23	367 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	RNF214	Q8ND24	703 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	OR51F2	Q8NH61	342 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	MUS81	Q96NY9	551 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	TRIM5	Q9C035	493 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	IPPK	Q9H8X2	491 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504		Q9N2J8	555 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	CA10	Q9NS85	328 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ASB6	Q9NWX5	421 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	C7orf72	A4D263	438 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	KLF11	O14901	512 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	PLOD3	O60568	738 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	COQ9	O75208	318 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	IGKV1D-16	P01601	117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	MTHFD2	P13995	350 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	STMN1	P16949	149 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC7A1	P30825	629 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	GABRA3	P34903	492 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC1A3	P43003	542 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	PPOX	P50336	477 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	IL13RA1	P78552	427 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC25A3	Q00325	362 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	GTF2H2	Q13888	395 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ADIPOQ	Q15848	244 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ADRM1	Q16186	407 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	OCLN	Q16625	522 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	PFKFB4	Q16877	469 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	OR4C3	Q8NH37	302 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	FBXO27	Q8NI29	283 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	NANP	Q8TBE9	248 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ZFP90	Q8TF47	636 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	PIK3R3	Q92569	461 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	APH1A	Q96BI3	265 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ERP27	Q96DN0	273 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	BBS4	Q96RK4	519 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	SLITRK2	Q9H156	845 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	TPK1	Q9H3S4	243 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	PLK3	Q9H4B4	646 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	NTN4	Q9HB63	628 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	RNF14	Q9UBS8	474 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	VWF	P04275	2813 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF724	A8MTY0	619 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ALG1L2	C9J202	215 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	WNT9B	O14905	357 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	UGDH	O60701	494 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	CYTIP	O60759	359 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	PRSS23	O95084	383 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	KCNH1	O95259	989 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	IL3	P08700	152 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	ADRA2A	P08913	450 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	LINGO3	P0C6S8	592 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	GAA	P10253	952 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HDLBP-222	ENST00000449504	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41

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