RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCOLCEQ15113 449 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 FGD3Q5JSP0 725 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ULK3Q6PHR2 472 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GDF7Q7Z4P5 450 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC43A2Q8N370 569 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 DUSP21Q9H596 190 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCN3BQ9NY72 215 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 RHCGQ9UBD6 479 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYOTQ9UBF9 498 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SEC16AO15027 2179 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADAMTS20P59510 1910 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0B4J2E0 115 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1B0GX12 115 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLF4O43474 513 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHP2O43745 196 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PPM1BO75688 479 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CYP4B1P13584 511 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 FPR3P25089 353 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ELK4P28324 431 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 IL12BP29460 328 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GGT2P36268 569 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 FOLR3P41439 243 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 OMPP47874 163 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GSSP48637 474 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 UGT2B15P54855 530 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDH15P55291 814 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTBP2P56545 445 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLAURQ03405 335 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRKCDQ05655 676 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAPSNQ13702 412 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 LAPTM4AQ15012 233 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 HES3Q5TGS1 186 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 DHRS13Q6UX07 377 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDK20Q8IZL9 346 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMCO6Q96DC7 493 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 OMA1Q96E52 524 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 IP6K3Q96PC2 410 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADOQ96SZ5 270 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 DOK1Q99704 481 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 IL20Q9NYY1 176 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TCFL5Q9UL49 500 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPTBP11277 2137 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CACNA1HO95180 2353 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZAR1LA6NP61 321 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC1A7O00341 560 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SOCS6O14544 535 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF264O43296 627 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR6B1O95007 311 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANGPTL1O95841 491 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GKN3PP0CG01 181 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PNMTP11086 282 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX6A1P12074 109 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms