RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442708.5

USP39-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-205ENST00000442708 GXYLT1Q4G148 440 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 VASNQ6EMK4 673 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 CD163Q86VB7 1156 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 IFNEQ86WN2 208 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 OR5W2Q8NH69 310 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 POC1BQ8TC44 478 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 TIMP4Q99727 224 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 SH3GL1Q99961 368 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.51□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 OR2M5A3KFT3 312 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 CDHR4A6H8M9 788 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 OR14I1A6ND48 311 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 TPST1O60507 370 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 SEMA7AO75326 666 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 EPPINO95925 133 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 TPOP07202 933 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 IL11P20809 199 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 PCGF2P35227 344 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 SLC7A2P52569 658 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 CRYBA2P53672 197 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 RBBP4Q09028 425 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ART3Q13508 389 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 KRT72Q14CN4 511 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 VMACQ2NL98 169 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 HIPK4Q8NE63 616 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ECSITQ9BQ95 431 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 HHATLQ9HCP6 504 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.5□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 AP3D1O14617 1153 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 EFNA2O43921 213 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 NUDT14O95848 222 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 THBS1P07996 1170 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 T-ENOLP0DO92 83 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ETS2P15036 469 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 CA7P43166 264 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 LHX2P50458 406 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 CCR4P51679 360 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 PSME3P61289 254 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 FOXF1Q12946 379 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 QPRTQ15274 297 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 LIN52Q52LA3 116 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 RAET1LQ5VY80 246 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 CMIPQ8IY22 773 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 SARAFQ96BY9 339 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 SFXN2Q96NB2 322 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.49□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 MAST4O15021 2626 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 A0A087WZY1 265 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 C7orf72A4D263 438 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 BCKDKO14874 412 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 LRRTM2O43300 516 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 MFN2O95140 757 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 NTN1O95631 604 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ACTL6AO96019 429 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 OPN1SWP03999 348 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 GKN3PP0CG01 181 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 PRG2P13727 222 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 PRKCAP17252 672 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 CHMP24386 653 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 RYKP34925 604 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 CLDN15P56746 228 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 SLC25A3Q00325 362 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 LIPEQ05469 1076 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 DMTNQ08495 405 aa14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
USP39-205ENST00000442708 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms