RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIGLEC7Q9Y286 467 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GWA3 101 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF749O43361 778 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFPL3O75679 317 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RCBTB2O95199 551 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAGP10523 405 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C22orf42Q6IC83 251 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLBD1Q6P4A8 553 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMARCD3Q6STE5 483 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THSD4Q6ZMP0 1018 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GID4Q8IVV7 300 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABHD8Q96I13 439 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHOX2BQ99453 314 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXQ1Q9C009 403 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCED1AQ9H1Q7 454 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FN3KQ9H479 309 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q9N2J8 555 aa17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPIPB9F8W1W9 429 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRTM2O43300 516 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL1AP01583 271 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CT45A8P0DMV1 189 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CT45A9P0DMV2 189 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF141Q15928 474 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CT45A2Q5DJT8 189 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NIPAL3Q6P499 406 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CADM3Q8N126 398 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIRT6Q8N6T7 355 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSD4Q8NDX1 1056 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OTULINQ96BN8 352 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF426Q9BUY5 554 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JAM3Q9BX67 310 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RERGLQ9H628 205 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE7BQ9NP56 450 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVK13-1Q9NX77 482 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVK-19Q9WJR5 959 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDH15Q96QU1 1955 aa17.27■□□□□ 0.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMO7DNF2Z398 122 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDRT1O95170 752 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LALBAP00709 142 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABRA5P31644 462 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V1E1P36543 226 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGDP52209 483 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSD17B7P56937 341 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FUT7Q11130 342 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC20Q12834 499 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBX3Q13185 183 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGFBP1Q14512 234 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NNATQ16517 81 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCTE1Q5JU00 501 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LSMEM1Q8N8F7 131 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR51Q1Q8NH59 317 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C16orf52Q8NHV5 167 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A46Q96AG3 418 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP19Q96LK0 163 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC30A2Q9BRI3 323 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM2Q9C040 744 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPK1Q9H3S4 243 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOR4AQ9NXH8 423 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 J3QRE1 110 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC30A4O14863 429 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDC3O75056 442 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFSF8P32971 234 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEPHS1P49903 392 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NXPH1P58417 271 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MXD1Q05195 221 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALG10BQ5I7T1 473 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 QSOX2Q6ZRP7 698 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL36Q8N4N3 616 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFP41Q8N8Y5 198 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPA12BQ96MM6 686 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM210AQ96ND0 272 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TM9SF2Q99805 663 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 G6PC3Q9BUM1 346 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFT27Q9BW83 186 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10A5Q9H207 317 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SP140LQ9H930 580 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED20Q9H944 212 aa17.26■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAV27A0A087WT01 109 aa17.25■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa17.25■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FITM1A5D6W6 292 aa17.25■□□□□ 0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSL3P1P0C860 447 aa17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms