RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 ADH7P40394 386 aa18.44■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 CCR4P51679 360 aa18.44■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ST3GAL3Q11203 375 aa18.44■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 SLC36A3Q495N2 470 aa18.44■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 CADM2Q8N3J6 435 aa18.44■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa18.44■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 SIRT6Q8N6T7 355 aa18.44■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 OR4K5Q8NGD3 323 aa18.44■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 RNF217Q8TC41 542 aa18.44■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 A0A1B0GWA3 101 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 TRAPPC13A5PLN9 417 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 FAAHO00519 579 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ZNF264O43296 627 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 DENRO43583 198 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 NDUFB5O43674 189 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ANGPTL1O95841 491 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 NGFRP08138 427 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 SPINK2P20155 84 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 SMIM11AP58511 58 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 EPS8Q12929 822 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 TRAM2Q15035 370 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 OR5M10Q6IEU7 315 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 DHRSXQ8N5I4 330 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 SLC22A8Q8TCC7 542 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 GPA33Q99795 319 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 RIBC2Q9H4K1 309 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 FAM118AQ9NWS6 357 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 HRH3Q9Y5N1 445 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 HCRTR2O43614 444 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 PIP5K1CO60331 668 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 FMO6PO60774 539 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 FBXO45P0C2W1 286 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 LCN1P31025 176 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 MED21Q13503 144 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 PGBD2Q6P3X8 592 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 IGF2-ASQ6U949 168 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ZNF559Q9BR84 538 aa18.43■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 A0A0B4J2E0 115 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 A0A1B0GX12 115 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 DXOO77932 396 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 WISP1O95388 367 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 MST1P26927 711 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 CAPGP40121 348 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 CMPK2Q5EBM0 449 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 IL20RBQ6UXL0 311 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ZNF550Q7Z398 422 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ZER1Q7Z7L7 766 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 NACC2Q96BF6 587 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 PSD2Q9BQI7 771 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 KLK13Q9UKR3 277 aa18.42■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 A0A1W2PQD3 144 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 TRABD2BA6NFA1 517 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 GNB5O14775 395 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 PSPHP78330 225 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 EFR3AQ14156 821 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 KLHL17Q6TDP4 642 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ZNF730Q6ZMV8 503 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 P3H2Q8IVL5 708 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 DUSP19Q8WTR2 217 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 TMEM27Q9HBJ8 222 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 MPDZO75970 2070 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 CEP295Q9C0D2 2601 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ARRDC5A6NEK1 342 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 LINGO3P0C6S8 592 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 LIPCP11150 499 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ANXA8P13928 327 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 NAGAP17050 411 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 WT1P19544 449 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 IDH2P48735 452 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 MLF1P58340 268 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 PDK3Q15120 406 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 NTRK2Q16620 822 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 RAB43Q86YS6 212 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 LSMEM1Q8N8F7 131 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 PSMF1Q92530 271 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 SLC38A4Q969I6 547 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD60Q9BZ19 345 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD10Q9NXR5 420 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 CNIH4Q9P003 139 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ICAM5Q9UMF0 924 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ORC6Q9Y5N6 252 aa18.41■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 H3BNH8 94 aa18.4■□□□□ 0.54
ODC1-202ENST00000405333 ICAM2P13598 275 aa18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms