RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389675.6

MRPL28-202, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene MRPL28, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28-202ENST00000389675 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 OR5W2Q8NH69 310 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 LAT2Q9GZY6 243 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 MEMO1Q9Y316 297 aa14.75□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 OR2M5A3KFT3 312 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 H0Y3Z8 333 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 LINC01387J3KSC0 135 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 FAM107AO95990 144 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 NID1P14543 1247 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 STARP49675 285 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SKP2Q13309 424 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.059e-6■■■■■ 27.7
MRPL28-202ENST00000389675 DCST1Q5T197 706 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 C1orf185Q5T7R7 199 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 TREML1Q86YW5 311 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 C10orf111Q8N326 155 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SMPDL3BQ92485 455 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ECSITQ9BQ95 431 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 NANOGQ9H9S0 305 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 STOML1Q9UBI4 398 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 IFT52Q9Y366 437 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.74□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 CLDN24A6NM45 220 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 AHRRA9YTQ3 701 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 H3BML4 177 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PGM3O95394 542 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PEPDP12955 493 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ZNF17P17021 662 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PGCP20142 388 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ME2P23368 584 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 RYKP34925 604 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PTGER4P35408 488 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PGM1P36871 562 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 RBBP4Q09028 425 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ART3Q13508 389 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 RABL3Q5HYI8 236 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 VRK2Q86Y07 508 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 MEIOBQ8N635 442 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 HIPK4Q8NE63 616 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 OR10A6Q8NH74 314 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 GPR119Q8TDV5 335 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 CCDC120Q96HB5 630 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 RNF145Q96MT1 663 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ZNF607Q96SK3 696 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PIF1Q9H611 641 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 FXYD1O00168 92 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 SEC14L5O43304 696 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ZG16O60844 167 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 LDLRP01130 860 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 THBS1P07996 1170 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 UQCRBP14927 111 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 ETS2P15036 469 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 CPN1P15169 458 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPL28-202ENST00000389675 AQP1P29972 269 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms