RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 CSTAP01040 98 aa24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 SHC1P29353 583 aa24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 DSTNP60981 165 aa24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 FOXF2Q12947 444 aa24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 LRIF1Q5T3J3 769 aa24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 MEIOBQ8N635 442 aa24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 GPR119Q8TDV5 335 aa24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 FIG4Q92562 907 aa24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 VAPAQ9P0L0 249 aa24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 LIPT1Q9Y234 373 aa24.31■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 HSPB2A8KAH6 182 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 CLIC1O00299 241 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 EFNA2O43921 213 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 IL2RAP01589 272 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 BCHEP06276 602 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 NR2F1P10589 423 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 PGM1P36871 562 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 HSPB2Q16082 182 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 FAM71CQ8NEG0 241 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 OR5W2Q8NH69 310 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO27Q8NI29 283 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 UCN2Q96RP3 112 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 CHST11Q9NPF2 352 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 KCNJ16Q9NPI9 418 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM45AQ9NWC5 275 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 AP4B1Q9Y6B7 739 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 PCNX3Q9H6A9 2034 aa24.3■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PP18 115 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 LINC01387J3KSC0 135 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 ADAM11O75078 769 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 PRKCAP17252 672 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 BMP5P22003 454 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 QPRTQ15274 297 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 RGNQ15493 299 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 RETREG3Q86VR2 466 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 GCNT2Q8N0V5 402 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 WNT2BQ93097 391 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 PINK1Q9BXM7 581 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 LAT2Q9GZY6 243 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 IKZF5Q9H5V7 419 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 P2RX2Q9UBL9 471 aa24.29■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 AGAP5A6NIR3 686 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 TFPTP0C1Z6 253 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 PRF1P14222 555 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 METTL25Q8N6Q8 603 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 SLC38A5Q8WUX1 472 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 MAL2Q969L2 176 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 MARVELD3Q96A59 401 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRG7Q96K78 797 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 DSPPQ9NZW4 1301 aa24.28■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJA2O60884 412 aa24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 NTN1O95631 604 aa24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEA8P43361 318 aa24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 ARFIP2P53365 341 aa24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 ACBD4Q8NC06 268 aa24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM19Q96HH6 336 aa24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM8Q9BZR9 551 aa24.27■■□□□ 1.48
TPGS1-201ENST00000359315 RAC1P63000 192 aa24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 KCNJ10P78508 379 aa24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 CBFBQ13951 182 aa24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 METTL21CQ5VZV1 264 aa24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 DLEU7Q6UYE1 221 aa24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 FNDC9Q8TBE3 224 aa24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 OIT3Q8WWZ8 545 aa24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ENKD1Q9H0I2 346 aa24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa24.26■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0J9YW62 118 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 SLC22A20A6NK97 555 aa24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TPGS1-201ENST00000359315 RCBTB2O95199 551 aa24.25■■□□□ 1.47
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