RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 OPRD1P41143 372 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PPA1Q15181 289 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ESCO2Q56NI9 601 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CARD17Q5XLA6 110 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 HBMQ6B0K9 141 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SBSNQ6UWP8 590 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ACBD4Q8NC06 268 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TFAP2CQ92754 450 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CRB3Q9BUF7 120 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PPH5 198 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NPIPA7E9PJI5 369 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NPIPA8P0DM63 369 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TUBG1P23258 451 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 GPR4P46093 362 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CSNK1A1P48729 337 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CX3CR1P49238 355 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 FAM69BQ5VUD6 431 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CLMPQ9H6B4 373 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 WIF1Q9Y5W5 379 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ANTXRLA6NF34 631 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SERPINA5P05154 406 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM225BP0DP42 221 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CD46P15529 392 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PTH2RP49190 550 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SLC35A1P78382 337 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MOKQ9UQ07 419 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NME7Q9Y5B8 376 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 F5H5P2 479 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MED6O75586 246 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SLC34A2O95436 690 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MAN2A2P49641 1150 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SGSHP51688 502 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OLIG2Q13516 323 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 DCST2Q5T1A1 773 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 COG8Q96MW5 612 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 STRCQ7RTU9 1775 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TAF1P21675 1872 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PRSS38A1L453 326 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TFP02787 698 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CNIH2Q6PI25 160 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NAXEQ8NCW5 288 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR1S1Q8NH92 325 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 HHIPL1Q96JK4 782 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 C19orf43Q9BQ61 176 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR51J1Q9H342 316 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 UBQLN4Q9NRR5 601 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 DRGXA6NNA5 263 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 B4DXG7 233 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 UPK1BO75841 260 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZFAND5O76080 213 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 EFNA3P52797 238 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 RAP2BP61225 183 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SLC35F3Q8IY50 421 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SVBPQ8N300 66 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CREB3L4Q8TEY5 395 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 FAM3CQ92520 227 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF597Q96LX8 424 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 IP6K3Q96PC2 410 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K3Q99759 626 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CWH43Q9H720 699 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CACNG4Q9UBN1 327 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CD8B2A6NJW9 211 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 J3QRK9 145 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CD8BP10966 210 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 AOAHP28039 575 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CD6P30203 668 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 VEGFCP49767 419 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 C3orf38Q5JPI3 329 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 LDLRAD1Q5T700 205 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PGAP1Q75T13 922 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms