RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HPGDSO60760 199 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 JUNP05412 331 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CYC1P08574 325 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TACR1P25103 407 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GRPRP30550 384 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CA5AP35218 305 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RPS21P63220 83 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KIR2DS3Q14952 304 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 OR2A12Q8NGT7 310 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LCN9Q8WX39 176 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM125Q96AQ2 219 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SCMH1Q96GD3 660 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 CORINQ9Y5Q5 1042 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GTQ1 180 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A0G2JN53 185 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 CDK14O94921 469 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RAB3DO95716 219 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TFAP2AP05549 437 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DDCP20711 480 aa4.63□□□□□ -1.67
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