RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 K7ENP7 123 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OIP5O43482 229 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPST2O60704 377 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNX4O95219 450 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 H1F0P07305 194 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QTNF9P0C862 333 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSX1P28360 303 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTGDSP41222 190 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARG2P78540 354 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 CBFBQ13951 182 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1Q1Q15612 314 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 PACS2Q86VP3 889 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 CADM2Q8N3J6 435 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5W2Q8NH69 310 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF32Q9H0A6 362 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SELENONQ9NZV5 590 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 U3KQV3 271 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP295Q9C0D2 2601 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 DOCK10Q96BY6 2186 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5H15A6NDH6 313 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFRSF11BO00300 401 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5F1O95221 314 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF23P17027 643 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGCP20142 388 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 MASP1P48740 699 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST3GAL3Q11203 375 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL28A1Q2UY09 1125 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 COLEC12Q5KU26 742 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPINK14Q6IE38 97 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5M10Q6IEU7 315 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF563Q8TA94 476 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 EME1Q96AY2 570 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDCCAG3Q96C92 435 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACAD8Q9UKU7 415 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 NTNG1Q9Y2I2 539 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAPPC13A5PLN9 417 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 FFAR1O14842 300 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGD3Q5JSP0 725 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF605Q86T29 641 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OFCC1Q8IZS5 231 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIK3C3Q8NEB9 887 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52J3Q8NH60 311 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF217Q8TC41 542 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPYCQ99645 322 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.65e-26■■□□□ 14.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMCC3Q9ULS5 477 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ICAM5Q9UMF0 924 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 APC2O95996 2303 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 NINQ8N4C6 2090 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAC3D1A6NKF1 404 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEMA7AO75326 666 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A12O75746 678 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEACAM4O75871 244 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS23O95084 383 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 HTR2AP28223 471 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 IDH2P48735 452 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 GK3PQ14409 553 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF613Q6PF04 617 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SVOPLQ8N434 492 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4K17Q8NGC6 315 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5K1Q8NHB7 308 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 HAS2Q92819 552 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARSGQ96EG1 525 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC41A3Q96GZ6 507 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 G3V3Y1 287 aa25.02■■□□□ 1.6
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FPR1P21462 350 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAM2Q15035 370 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 WBP2NLQ6ICG8 309 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 BORAQ6PGQ7 559 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF227Q86WZ6 799 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 LSMEM1Q8N8F7 131 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf34Q96MH7 638 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 VCX3BQ9H321 246 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTGES2Q9H7Z7 377 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACER3Q9NUN7 267 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED11Q9P086 117 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED13Q9UHV7 2174 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDM4Q9UKN5 801 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OAZ3Q9UMX2 235 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf51A8MQB3 221 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 G3V2T6 193 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAAHO00519 579 aa25.01■■□□□ 1.59
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