RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299353.6

BORCS7-ASMT-201, Transcript of BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene BORCS7-ASMT, Length 2,670 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CDRT1O95170 752 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TIAF1O95411 115 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 IFNA14P01570 189 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CHRM4P08173 479 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 BCL6P41182 706 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 AVPR1BP47901 424 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CSNK1G2P78368 415 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HSF2Q03933 536 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZNF91Q05481 1191 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RBBP4Q09028 425 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GRM7Q14831 915 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RTL4Q6ZR62 310 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 VRK2Q86Y07 508 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FRMD1Q8N878 549 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PHF21AQ96BD5 680 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LRR1Q96L50 414 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 BBS4Q96RK4 519 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SOSTQ9BQB4 213 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KXD1Q9BQD3 176 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 WACQ9BTA9 647 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 IL23AQ9NPF7 189 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MALT1Q9UDY8 824 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KIF25Q9UIL4 384 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 A0A1W2PPL8 197 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 A0A1W2PR48 441 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 EML2O95834 649 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RB1P06400 928 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FUT1P19526 365 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ETV5P41161 510 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FUT5Q11128 374 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GINS1Q14691 196 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 IRF4Q15306 451 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DUSP6Q16828 381 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 C2orf27AQ580R0 203 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 METRNLQ641Q3 311 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 C22orf42Q6IC83 251 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LCTLQ6UWM7 567 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CASP12Q6UXS9 341 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 Q8N402 240 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CEP76Q8TAP6 659 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KCNJ15Q99712 375 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MED28Q9H204 178 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NT5DC2Q9H857 520 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MAFFQ9ULX9 164 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SSR3Q9UNL2 185 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LIPT1Q9Y234 373 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 A0A0A6YYJ9 748 aa6.49□□□□□ -1.37
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms