RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JNG1 304 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 B4DXG7 233 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RGS13O14921 159 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CSTAP01040 98 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR2T7P0C7T2 308 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PNMTP11086 282 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FUT4P22083 530 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SSTR4P31391 388 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ACVR1BP36896 505 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 YPEL5P62699 121 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SHC2P98077 582 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FOXK2Q01167 660 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KIR2DS5Q14953 304 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR8H3Q8N146 312 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR2T27Q8NH04 317 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 EMC7Q9NPA0 242 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RASD1Q9Y272 281 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LATO43561 262 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C1QBP02746 253 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CD2P06729 351 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 IL12BP29460 328 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 HTR2BP41595 481 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CLDN20P56880 219 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC35D3Q5M8T2 416 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ABHD4Q8TB40 342 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GIMAP5Q96F15 307 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C4orf36Q96KX1 117 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ATF6BQ99941 703 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MACROD1Q9BQ69 325 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 POT1Q9NUX5 634 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 IL20Q9NYY1 176 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 COMMD9Q9P000 198 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 UBL3O95164 117 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SOD1P00441 154 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 UGT2B7P16662 529 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FABP5Q01469 135 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 33.9
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NIPAL3Q6P499 406 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 USP53Q70EK8 1073 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ASB12Q8WXK4 309 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 BEX2Q9BXY8 128 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR51J1Q9H342 316 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CBLCQ9ULV8 474 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 VWA8A3KMH1 1905 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF10CO14798 259 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CHP2O43745 196 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MOSPD3O75425 235 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NUDT1P36639 197 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 HOXC5Q00444 222 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FAPQ12884 760 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 BAK1Q16611 211 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 AGBL4Q5VU57 503 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RIT1Q92963 219 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MNTQ99583 582 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.23□□□□□ -1.09
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