RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 MED11Q9P086 117 aa6.04□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.04□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 CSO75390 466 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 CRISP1P54107 249 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 SNAPC1Q16533 368 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 KLHL12Q53G59 568 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 VASH2Q86V25 355 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF563Q8TA94 476 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.03□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 KLHL1Q9NR64 748 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 THSD1Q9NS62 852 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 GRPRP30550 384 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 FXYD6P3P58550 94 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 SKP1P63208 163 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 RNF4P78317 190 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 ARSKQ6UWY0 536 aa6.03□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 SMPDL3BQ92485 455 aa6.03□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 TMEM203Q969S6 136 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 PRRC1Q96M27 445 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 LPAR4Q99677 370 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 PINK1Q9BXM7 581 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 UCK2Q9BZX2 261 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 LHPPQ9H008 270 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 RAB33BQ9H082 229 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.03□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.03□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 C9orf172C9J069 976 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 UMODP07911 640 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 KLK2P20151 261 aa6.03□□□□□ -1.44
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CNIH1-201ENST00000216416 RORAP35398 523 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 LIMS1P48059 325 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.03□□□□□ -1.44
CNIH1-201ENST00000216416 LRR1Q96L50 414 aa6.03□□□□□ -1.44
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