RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641815.1

STX3-208, Transcript of syntaxin 3, human

BASIC

Gene STX3, Length 3,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX3-208	ENST00000641815	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		A0A1B0GUH1	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MBTPS2	O43462	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	STX11	O75558	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CD40	P25942	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	IL12B	P29460	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FMO3	P31513	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MMP12	P39900	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	EMP2	P54851	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FOXA1	P55317	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MLF1	P58340	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	BAMBI	Q13145	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TEX37	Q96LM6	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		A0A1W2PRB8	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		A8MZ25	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		E5RI56	91 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		J3KTA2	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815		M0R082	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RAB27B	O00194	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MMP20	O60882	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CREG1	O75629	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	C1QB	P02746	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CDK1	P06493	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	THBD	P07204	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MSX1	P28360	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ADORA2B	P29275	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	LIPA	P38571	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CHRNA4	P43681	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	CDKN2D	P55273	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SOX8	P57073	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	AP3S2	P59780	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	NKG7	Q16617	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	DUSP6	Q16828	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	OR2T29	Q8NH02	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ELMO1	Q92556	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	ESAM	Q96AP7	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STX3-208	ENST00000641815	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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