RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PROP1O75360 226 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 AKR7A3O95154 331 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFB8O95169 186 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 EPN2O95208 641 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 BMP10O95393 424 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPAN12O95859 305 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CH25HO95992 272 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV2-14P01704 120 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 UGT1A6P19224 532 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 KELP23276 732 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 DGKAP23743 735 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MPGP29372 298 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 HMOX2P30519 316 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CD70P32970 193 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 NSG1P42857 185 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMD8P48556 350 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ERFP50548 548 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 THOP1P52888 689 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PKNOX1P55347 436 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SRP54P61011 504 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 COL10A1Q03692 680 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 NFATC2Q13469 925 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 DMC1Q14565 340 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TGFBIQ15582 683 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIP10Q15642 601 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CEBPEQ15744 281 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR33Q49SQ1 333 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CARD16Q5EG05 197 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 COQ5Q5HYK3 327 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM46CQ5VWP2 391 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA24Q86W54 205 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 AMIGO1Q86WK6 493 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PIANPQ8IYJ0 282 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 Q8N1X5 172 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LEMD2Q8NC56 503 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 C7orf57Q8NEG2 295 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 DENND6BQ8NEG7 585 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6K2Q8NGY2 324 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF128Q8TEB7 428 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ULK4Q96C45 1275 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM14Q96QK8 99 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNA7Q96RP8 456 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 RASL10BQ96S79 203 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LYSMD1Q96S90 227 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF382Q96SR6 550 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM15Q9C019 465 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 VCXQ9H320 206 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 Q9H521 79 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 Q9H8V8 135 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ACKR4Q9NPB9 350 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 GID8Q9NWU2 228 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SOHLH2Q9NX45 425 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 DCAF16Q9NXF7 216 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 WWOXQ9NZC7 414 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PKD2L2Q9NZM6 624 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SUN2Q9UH99 717 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PCTPQ9UKL6 214 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 HS3ST2Q9Y278 367 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 BTRCQ9Y297 605 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFAF1Q9Y375 327 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 DHRS7Q9Y394 339 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 OARD1Q9Y530 152 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 INSL6Q9Y581 213 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 DENND4AQ7Z401 1863 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CKAP5Q14008 2032 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC28Q96AY4 2481 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PIEZO1Q92508 2521 aa3.83□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A087X0K7 114 aa3.82□□□□□ -1.8
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