RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SRRQ9GZT4 340 aa15.25■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.25■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UCK1Q9HA47 277 aa15.25■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CMC2Q9NRP2 79 aa15.25■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KNL1Q8NG31 2342 aa15.24■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM86C2PA6NEL3 165 aa15.24■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.24■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TGFBR3LH3BV60 316 aa15.24■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HRO43593 1189 aa15.24■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTP4A3O75365 173 aa15.24■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APOA1P02647 267 aa15.24■□□□□ 0.03
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