RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 ADCK2Q7Z695 626 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MFSD4AQ8N468 514 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CAMKVQ8NCB2 501 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 OR2L3Q8NG85 312 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 PIGXQ8TBF5 258 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 NAT6Q93015 286 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TP53INP1Q96A56 240 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CEP19Q96LK0 163 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 F2RL3Q96RI0 385 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 SERINC2Q96SA4 455 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CSF3RQ99062 836 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MGLLQ99685 303 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MED18Q9BUE0 208 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 JAM3Q9BX67 310 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 ACTRT3Q9BYD9 372 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 LYRM4Q9HD34 91 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 SSR3Q9UNL2 185 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 DGKBQ9Y6T7 804 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 A0A087WV62 115 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 H7BY64 318 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 AP3D1O14617 1153 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MID1O15344 667 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MAN1A2O60476 641 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 DIRAS1O95057 198 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 RORCP51449 518 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 VBP1P61758 197 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TSPAN31Q12999 210 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 GPR50Q13585 617 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CDSNQ15517 529 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 DECR1Q16698 335 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 FAM219BQ5XKK7 198 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 ZNF425Q6IV72 752 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MRGPREQ86SM8 312 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TRIM74Q86UV6 250 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 GID4Q8IVV7 300 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 OR13H1Q8NG92 308 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TANKQ92844 425 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 PRAP1Q96NZ9 151 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 WDFY2Q96P53 400 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 STACQ99469 402 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 CMKLR1Q99788 373 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 FUZQ9BT04 418 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 DPH7Q9BTV6 452 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 NUAK2Q9H093 628 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-218ENST00000584243 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms