RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577524.5

ARHGAP28-208, Transcript of Rho GTPase activating protein 28, human

TSL 5

Gene ARHGAP28, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NTM	Q9P121	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524		A8MXE2	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524		E9PBE3	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	HDAC3	O15379	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF264	O43296	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CXCL13	O43927	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	STX11	O75558	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CTAG2	O75638	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ANP32D	O95626	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	KRT75	O95678	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TGM6	O95932	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CSTA	P01040	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OPN1LW	P04000	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	UBL4A	P11441	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	UQCRB	P14927	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PGC	P20142	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	UQCRC2	P22695	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SFTPD	P35247	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CD79B	P40259	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	KHK	P50053	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	P2RX1	P51575	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ART1	P52961	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NME5	P56597	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CLDN20	P56880	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CARD18	P57730	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	STX1B	P61266	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	HBA1	P69905	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OCRL	Q01968	901 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	BST1	Q10588	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FOXF2	Q12947	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CBFB	Q13951	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FIG4	Q92562	907 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OSTF1	Q92882	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NINJ1	Q92982	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TESC	Q96BS2	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR7D2	Q96RA2	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PANX1	Q96RD7	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR51I1	Q9H343	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RMND5A	Q9H871	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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