RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 GUCY1B2O75343 617 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 TNFSF13O75888 250 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 HSD17B1P14061 328 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 SRD5A1P18405 259 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 REEP4Q9H6H4 257 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 KLK1P06870 262 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 DDCP20711 480 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 CPN2P22792 545 aa8.38□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 THBS2P35442 1172 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 SOX18P35713 384 aa8.38□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 BIKQ13323 160 aa8.38□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 JADE3Q92613 823 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 STARD4Q96DR4 205 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 ASB9Q96DX5 294 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 FBXL20Q96IG2 436 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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