RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	NAGA	P17050	411 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ABCD3	P28288	659 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TIMP3	P35625	211 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PRIM2	P49643	509 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	NRG3	P56975	720 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PSPH	P78330	225 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ARMCX1	Q9P291	453 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CAPN14	A8MX76	684 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	KCNAB3	O43448	404 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	C1QC	P02747	245 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	KRT16	P08779	473 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FREM3	P0C091	2139 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ACP2	P11117	423 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CTSS	P25774	331 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GABRA3	P34903	492 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	KCNJ2	P63252	427 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SORD	Q00796	357 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	DMTN	Q08495	405 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FAM27E3	Q08E93	113 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	NTRK2	Q16620	822 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	DUSP5	Q16690	384 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GTDC1	Q4AE62	458 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CDC73	Q6P1J9	531 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	RETREG3	Q86VR2	466 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	LACC1	Q8IV20	430 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PRR22	Q8IZ63	422 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	DPP10	Q8N608	796 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FBXO30	Q8TB52	745 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ZFP90	Q8TF47	636 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SMPDL3B	Q92485	455 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC9A6	Q92581	669 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	OMA1	Q96E52	524 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SGCZ	Q96LD1	299 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	STAC	Q99469	402 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222		Q9N2J8	555 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GIN1	Q9NXP7	522 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ANK2	Q01484	3957 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FBP2	O00757	339 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CASK	O14936	926 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ANGPT2	O15123	496 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PPM1B	O75688	479 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SOX30	O94993	753 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ANP32D	O95626	131 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ALOX5	P09917	674 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	MATN1	P21941	496 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	MAPRE2	Q15555	327 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GPR151	Q8TDV0	419 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PIK3R3	Q92569	461 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	JADE3	Q92613	823 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TMBIM1	Q969X1	311 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC35A4	Q96G79	324 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PIGU	Q9H490	435 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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