RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 PRPS1L1P21108 318 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 LOXP28300 417 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ATP12AP54707 1039 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 C21orf58P58505 322 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ZNF117Q03924 483 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 EMX2Q04743 252 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 TP53BP2Q13625 1128 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 DCST2Q5T1A1 773 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 PPP4R4Q6NUP7 873 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 CBLN3Q6UW01 205 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 NUDCD3Q8IVD9 361 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 WFDC11Q8NEX6 87 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 SFXN5Q8TD22 340 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 OSTF1Q92882 214 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 MOAP1Q96BY2 351 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 PIK3IP1Q96FE7 263 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 MED18Q9BUE0 208 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 DUSP26Q9BV47 211 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 NEUROD4Q9HD90 331 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 EMC9Q9Y3B6 208 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 C2CD3Q4AC94 2353 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 NPIPB9F8W1W9 429 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 SYNGR4O95473 234 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 KRT16P08779 473 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 NID1P14543 1247 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 FOSL1P15407 271 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ATP6V1C1P21283 382 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 SHC1P29353 583 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 P2RX1P51575 399 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 CLDN8P56748 225 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 HBA1P69905 142 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 SMU1Q2TAY7 513 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 SPDYE7PQ495Y7 208 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 PDSS1Q5T2R2 415 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ANKRD34AQ69YU3 496 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 HBMQ6B0K9 141 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 LILRA2Q8N149 483 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 MREGQ8N565 214 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 OR5AK3PQ8NH89 298 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ZNF524Q96C55 264 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 PKNOX2Q96KN3 472 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ZIM3Q96PE6 472 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 OR7D2Q96RA2 312 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 SDF2Q99470 211 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 KLHL4Q9C0H6 718 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 C20orf27Q9GZN8 174 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 TMEM185BQ9H7F4 350 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 GLRX2Q9NS18 164 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ASIC5Q9NY37 505 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ICAM5Q9UMF0 924 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 CARD8Q9Y2G2 431 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ACTL7BQ9Y614 415 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 WDR91A4D1P6 747 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 CFLARO15519 480 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 PLGP00747 810 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 THBDP07204 575 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 MATN1P21941 496 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ME2P23368 584 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ADH6P28332 368 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 EIF1P41567 113 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 CTBP2P56545 445 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 CARD18P57730 90 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 FOXF1Q12946 379 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 CHI3L2Q15782 390 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ACKR1Q16570 336 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 PGS1Q32NB8 556 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 OR4F3Q6IEY1 312 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 STAC2Q6ZMT1 411 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 CLECL1Q8IZS7 167 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ZNF781Q8N8C0 355 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ZNF527Q8NB42 609 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 OR5D16Q8NGK9 328 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 FBXO27Q8NI29 283 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 GPR119Q8TDV5 335 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ROBO4Q8WZ75 1007 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 KLHL15Q96M94 604 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 AKTIPQ9H8T0 292 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 DTNAQ9Y4J8 743 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 V9GYY5 206 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 H3BNH8 94 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 ZNF195O14628 629 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 BIRC5O15392 142 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 SCN2BO60939 215 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-229ENST00000551936 SERPINE1P05121 402 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms