RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NTN4Q9HB63 628 aa8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GP6Q9HCN6 339 aa8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CA10Q9NS85 328 aa8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SENP1Q9P0U3 644 aa8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSME2Q9UL46 239 aa8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.86□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A087WZY1 265 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 K7EPI3 171 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLF11O14901 512 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS23O95084 383 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGGP02679 453 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAAP10253 952 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FPR2P25090 351 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCH1P30793 250 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A3Q00325 362 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSG6Q00889 435 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABRA6Q16445 453 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DECR1Q16698 335 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALNT7Q86SF2 657 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRABD2AQ86V40 505 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC43A2Q8N370 569 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEX29Q8N6K0 151 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR31Q8NA23 367 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDPRQ8NCN5 879 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NANPQ8TBE9 248 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF681Q96N22 645 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DERL2Q9GZP9 239 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPK1Q9H3S4 243 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCO1Q9HAY6 547 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.85□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PNR3 127 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0QZ24 198 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFNA2O43921 213 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUPT3HO75486 399 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESRRBO95718 433 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTHFD2P13995 350 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD1DP15813 335 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPOXP50336 477 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC12A2P55011 1212 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSPHP78330 225 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR5P85299 388 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC18A2Q05940 514 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZP4Q12836 540 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXF1Q12946 379 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAMBIQ13145 260 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADIPOQQ15848 244 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADRM1Q16186 407 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSS51Q4VC12 460 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR7G2Q8NG99 324 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINI1Q99574 410 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLK3Q9H4B4 646 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALG9Q9H6U8 611 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.84□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H0YIV9 168 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBXN8O00124 270 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGS14O43566 566 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GUCY1B2O75343 617 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIAS1O75925 651 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC1A3P43003 542 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SGO1Q5FBB7 561 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIPJQ5W064 366 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR7E24Q6IFN5 339 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRICD5Q6PL45 260 aa8.83□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms