RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UQCRFS1P47985 274 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUMBP49757 651 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC34A1Q06495 639 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APOFQ13790 326 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPNMBQ14956 572 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POU2AF1Q16633 256 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZBED5Q49AG3 693 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SUSD4Q5VX71 490 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MED27Q6P2C8 311 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ISCA2Q86U28 154 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SYS1Q8N2H4 156 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SVOPLQ8N434 492 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EXD3Q8N9H8 876 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR7G2Q8NG99 324 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PTH2Q96A98 100 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C14orf144Q96I85 54 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGSF21Q96ID5 467 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM56Q96MV1 263 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FN3KQ9H479 309 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NT5DC2Q9H857 520 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RRAGCQ9HB90 399 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RLIMQ9NVW2 624 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EBF1Q9UH73 591 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB26Q9ULW5 256 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ABCC2Q92887 1545 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZFYVE9O95405 1425 aa6.59□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CGB1A6NKQ9 187 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DISC1C4P0D8 188 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 G3V3Y1 287 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEX33O43247 280 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LRP3O75074 770 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FZD7O75084 574 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SCELO95171 688 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SNHG28P0DPA3 235 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CD82P27701 267 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CALCRP30988 508 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CFHR2P36980 270 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LIMK2P53671 638 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HSPA2P54652 639 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR4D2P58180 307 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LCN2P80188 198 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM3AP98173 230 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FPGSQ05932 587 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MPPED2Q15777 294 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HLFQ16534 295 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IDNKQ5T6J7 187 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BICRALQ6AI39 1079 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR52W1Q6IF63 320 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms