RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 UBDO15205 165 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 EFNA2O43921 213 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 PEPDP12955 493 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 IDO1P14902 403 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CTSSP25774 331 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 IDH3AP50213 366 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 BHLHB9Q6PI77 547 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ANKFN1Q8N957 763 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 WNT2BQ93097 391 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 VPS33AQ96AX1 596 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZG16BQ96DA0 208 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ICAM5Q9UMF0 924 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.89■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 PDZD2O15018 2839 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 HMGN4O00479 90 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SLC22A3O75751 556 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 UGT2B17O75795 530 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 LINGO3P0C6S8 592 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SLC6A8P48029 635 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ASCL1P50553 236 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 PLAURQ03405 335 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TLE4Q04727 773 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 BCL2A1Q16548 175 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 VWA1Q6PCB0 445 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 FRRS1Q6ZNA5 592 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 C16orf62Q7Z3J2 963 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 MEIOBQ8N635 442 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 VPS37AQ8NEZ2 397 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 FNDC9Q8TBE3 224 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ROPN1LQ96C74 230 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 UCN2Q96RP3 112 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZBTB18Q99592 522 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 DTNAQ9Y4J8 743 aa16.88■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SERINC4A6NH21 518 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SLC22A20A6NK97 555 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CLDN24A6NM45 220 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 STX11O75558 287 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TNFSF13O75888 250 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 AQP8O94778 261 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 RCBTB2O95199 551 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 KHKP50053 298 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CCR4P51679 360 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 AQP5P55064 265 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SIRPAP78324 504 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 PON3Q15166 354 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.291e-7■□□□□ 9.6
TSTA3-211ENST00000529899 SYPL1Q16563 259 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 LUZP2Q86TE4 346 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 DTNBP1Q96EV8 351 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 LURAP1Q96LR2 239 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TM9SF2Q99805 663 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZIM2Q9NZV7 527 aa16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 POLQO75417 2590 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 A0A0J9YW62 118 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 A0A1W2PNV4 684 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TNFSF11O14788 317 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 KIAA0513O60268 411 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CYP7B1O75881 506 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 NUDT14O95848 222 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CHRM4P08173 479 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 UBL4AP11441 157 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF17P17021 662 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SFTPDP35247 375 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 P2RX1P51575 399 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 MVDP53602 400 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CHRNEQ04844 493 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SKP2Q13309 424 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 MAPK11Q15759 364 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF141Q15928 474 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 GSTA3Q16772 222 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 PPP4R4Q6NUP7 873 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SLC2A7Q6PXP3 512 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 P4HA3Q7Z4N8 544 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 MISPQ8IVT2 679 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms