RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	SPRY2	O43597	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	HCRTR2	O43614	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CD5L	O43866	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	NXPH3	O95157	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TGM6	O95932	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF708	P17019	499 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CD22	P20273	847 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CHM	P24386	653 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CCKAR	P32238	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GALNS	P34059	522 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GGT5	P36269	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	UGT2B10	P36537	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GDF5	P43026	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	HNMT	P50135	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TERF1	P54274	439 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	DIO3	P55073	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ATP5J2	P56134	94 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TGM3	Q08188	693 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FUT7	Q11130	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CRYM	Q14894	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ART5	Q96L15	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	OVOL3	O00110	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CDC7	O00311	574 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TAPBP	O15533	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CDH16	O75309	829 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CGA	P01215	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FGG	P02679	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CRH	P06850	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CREB1	P16220	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	NAGA	P17050	411 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PGAM1	P18669	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	EPOR	P19235	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CPN2	P22792	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CPOX	P36551	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CD79B	P40259	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PTGDS	P41222	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	VPS41	P49754	854 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	LHX2	P50458	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CLDN18	P56856	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	HERVK_113	P63132	956 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ERVK-8	P63133	956 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SRY	Q05066	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CBFB	Q13951	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	DOC2A	Q14183	400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TOMM20	Q15388	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ETFDH	Q16134	617 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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