RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF806P0C7X5 589 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SP9P0CG40 484 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CBR1P16152 277 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MMP12P39900 470 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CCR5P51681 352 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DUOXA1Q1HG43 343 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SBSNQ6UWP8 590 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OXR1Q8N573 874 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NIT2Q9NQR4 276 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CA10Q9NS85 328 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NDRG3Q9UGV2 375 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PTPRDP23468 1912 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SDC3O75056 442 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CTSLP07711 333 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RD3LP0DJH9 198 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MAPK9P45984 424 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RPIAP49247 311 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MVDP53602 400 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SELENOWP63302 87 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MC2RQ01718 297 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SERPINA9Q86WD7 417 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OR4A15Q8NGL6 344 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 EGFL8Q99944 293 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 BIN3Q9NQY0 253 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC11Q9NVH1 559 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PATJQ8NI35 1801 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ANTXRLA6NF34 631 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CD8B2A6NJW9 211 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GPR31O00270 319 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MANBAO00462 879 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 FFAR2O15552 330 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CER1O95813 267 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PDYNP01213 254 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TFP02787 698 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MT-ND4P03905 459 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CD8BP10966 210 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CR2P20023 1033 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 KIR3DL1P43629 444 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NAGSQ8N159 534 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ELP4Q96EB1 424 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 APIPQ96GX9 242 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TPT1P8Q9HAU6 139 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GPR37L1O60883 481 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TGM6O95932 706 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RNF224P0DH78 156 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OGNP20774 298 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 WNT3P56703 355 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SP140Q13342 867 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ELOCQ15369 112 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 IDNKQ5T6J7 187 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GKN2Q86XP6 184 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SIAH3Q8IW03 269 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NTMT1Q9BV86 223 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DCAF16Q9NXF7 216 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OR1A2Q9Y585 309 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NPTNQ9Y639 398 aa9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.42□□□□□ -0.9
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