RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505453.1

PDE4D-212, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4D, Length 1,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-212ENST00000505453 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 SLC38A4Q969I6 547 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 UBE2FQ969M7 185 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 GPA33Q99795 319 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 STRADBQ9C0K7 418 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ARMC7Q9H6L4 198 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 TRAPPC13A5PLN9 417 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 EFSO43281 561 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 FMO6PO60774 539 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ADAM11O75078 769 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 CSO75390 466 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 REM1O75628 298 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 UTS2O95399 124 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 OSMP13725 252 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 MMP11P24347 488 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 GSK3AP49840 483 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 CRISP1P54107 249 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 UGT2B15P54855 530 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 RNF4P78317 190 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 CDK5R2Q13319 367 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 APOFQ13790 326 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 OCLNQ16625 522 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 PARP8Q8N3A8 854 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 LINC00471Q8N535 108 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 C8orf44Q96CB5 159 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ADOQ96SZ5 270 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ZNF559Q9BR84 538 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ING2Q9H160 280 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 WDR54Q9H977 334 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 NCDNQ9UBB6 729 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 SLC7A7Q9UM01 511 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 CACNA1HO95180 2353 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 OIP5O43482 229 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 TSPAN2O60636 221 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 TFAP2AP05549 437 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 UMODP07911 640 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ATP6V1B1P15313 513 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 CHMP24386 653 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 GGT2P36268 569 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 RPS6KA3P51812 740 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ESRRGP62508 458 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 CD226Q15762 336 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ZSWIM7Q19AV6 140 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 DHRS13Q6UX07 377 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 APOOLQ6UXV4 268 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-212ENST00000505453 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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