RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 IFNL4K9M1U5 179 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TM9SF1O15321 606 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 B3GAT3O94766 335 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-DQA2P01906 255 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PPBPP02775 128 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GSTA1P08263 222 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SRFP11831 508 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ICAM2P13598 275 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GTF2F2P13984 249 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GABRR2P28476 465 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LIPAP38571 399 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 OR4D2P58180 307 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 IL13RA1P78552 427 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF45Q02386 682 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 DSC1Q08554 894 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RAB31Q13636 194 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RTP5Q14D33 572 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PSG5Q15238 335 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TNXAQ16473 311 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SFT2D3Q587I9 215 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LCTLQ6UWM7 567 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 COX15Q7KZN9 410 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PIM3Q86V86 326 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MREGQ8N565 214 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM163Q8TC26 289 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 IGSF8Q969P0 613 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ERGIC1Q969X5 290 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PTH2Q96A98 100 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RMND1Q9NWS8 449 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NLKQ9UBE8 527 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RAB26Q9ULW5 256 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NCANO14594 1321 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 JCADQ9P266 1359 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PRF3 423 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PRM7 423 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PSMB11A5LHX3 300 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 C17orf100A8MU93 164 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 H7C0C1 242 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 M0R296 226 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ADAM10O14672 748 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TCAPO15273 167 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SIVA1O15304 175 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 B4GALT5O43286 388 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RAMP3O60896 148 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ESRRBO95718 433 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CDK1P06493 297 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SP9P0CG40 484 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 EPCAMP16422 314 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NPR2P20594 1047 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MATN1P21941 496 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CHRNA5P30532 468 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PHBP35232 272 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINB5P36952 375 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CSKP41240 450 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GRIA3P42263 894 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 DNASE1L1P49184 302 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ACOT2P49753 483 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MAPK12P53778 367 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HMGCS2P54868 508 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GEMP55040 296 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 VLDLRP98155 873 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CFHR1Q03591 330 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.66□□□□□ -1.34
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