RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 OSTF1Q92882 214 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 MOAP1Q96BY2 351 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 C1orf50Q9BV19 199 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 FBXO34Q9NWN3 711 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 FAM171A2A8MVW0 826 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ADAMDEC1O15204 470 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TUBBP07437 444 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 INHBBP09529 407 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 NUDT17P0C025 328 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 LAMP1P11279 417 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 IL11P20809 199 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PRPS1L1P21108 318 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SFTPDP35247 375 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PTGR1Q14914 329 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 Q5PR19 223 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TMEM201Q5SNT2 666 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 IL23RQ5VWK5 629 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ZNF614Q8N883 585 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ARL8AQ96BM9 186 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TUBGCP3Q96CW5 907 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 KLHL15Q96M94 604 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 C12orf49Q9H741 205 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 GIMAP2Q9UG22 337 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SIAH2O43255 324 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 C6orf47O95873 294 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 P2RX1P51575 399 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 BEX5Q5H9J7 111 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 C6orf136Q5SQH8 315 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 DCST2Q5T1A1 773 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ADGRG7Q96K78 797 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 L2HGDHQ9H9P8 463 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 LGALS13Q9UHV8 139 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 A0A0J9YW62 118 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ELK4P28324 431 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ADH6P28332 368 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SOAT1P35610 550 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 NR1H2P55055 460 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ZNF117Q03924 483 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 FOXF1Q12946 379 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CD226Q15762 336 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 XKR7Q5GH72 579 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SFXN5Q8TD22 340 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 NPAS1Q99742 590 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CARD8Q9Y2G2 431 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 GPR52Q9Y2T5 361 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 HEATR5AQ86XA9 2040 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 NPIPA7E9PJI5 369 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 LINGO3P0C6S8 592 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 NPIPA8P0DM63 369 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ATP12AP54707 1039 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PGS1Q32NB8 556 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CLEC9AQ6UXN8 241 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 WFDC8Q8IUA0 241 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 NUDCD3Q8IVD9 361 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 RFWD2Q8NHY2 731 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 FBXO27Q8NI29 283 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 POC1BQ8TC44 478 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ROBO4Q8WZ75 1007 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 COQ8BQ96D53 544 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PERPQ96FX8 193 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 C3orf30Q96M34 536 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 HS3ST6Q96QI5 342 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 BDH2Q9BUT1 245 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 DUSP26Q9BV47 211 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CXorf36Q9H7Y0 433 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 DUXAA6NLW8 204 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 ZNF195O14628 629 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 BPGMP07738 259 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 AGTR1P30556 359 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 LTBQ06643 244 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 KLHL26Q53HC5 615 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 ALKBH2Q6NS38 261 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 STAC2Q6ZMT1 411 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-212ENST00000484841 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa18.01■□□□□ 0.47
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