RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484048.1

UBE2E1-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E1, Length 786 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1-209ENST00000484048 TMCO6Q96DC7 493 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2E1-209ENST00000484048 ARHGDIGQ99819 225 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2E1-209ENST00000484048 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2E1-209ENST00000484048 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2E1-209ENST00000484048 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2E1-209ENST00000484048 NCKAP5O14513 1909 aa14.78□□□□□ -0.04
UBE2E1-209ENST00000484048 CDHR4A6H8M9 788 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 SERINC4A6NH21 518 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CDK2AP1O14519 115 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 ADAM10O14672 748 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 HPGDP15428 266 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 TNFRSF1BP20333 461 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 MAGEA2P43356 314 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 KCNAB2Q13303 367 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 RIPK1Q13546 671 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 TBCELQ5QJ74 424 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 C7orf34Q96L11 122 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 RLIMQ9NVW2 624 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 HPF1Q9NWY4 346 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 GPR83Q9NYM4 423 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 STMN3Q9NZ72 180 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 AP4S1Q9Y587 144 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 A6NL46 340 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 TP53I11O14683 189 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 OR1E2P47887 323 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 HLCSP50747 726 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 VLDLRP98155 873 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CD226Q15762 336 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CARM1Q86X55 608 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 LACC1Q8IV20 430 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 GRHL3Q8TE85 626 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CHID1Q9BWS9 393 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 ABI3Q9P2A4 366 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 M0R3H8 397 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CEACAM4O75871 244 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CSTAP01040 98 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 MT-ND1P03886 318 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 FABP3P05413 133 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 PTGDSP41222 190 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CCL11P51671 97 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 GAS1P54826 345 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 RAPSNQ13702 412 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 BORAQ6PGQ7 559 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 RTL4Q6ZR62 310 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 MARCH3Q86UD3 253 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 GATSQ8NAP1 163 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC35B4Q969S0 331 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 NTNG2Q96CW9 530 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 SGCZQ96LD1 299 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 AGAP4Q96P64 663 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 YY1AP1Q9H869 796 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2E1-209ENST00000484048 H3BNH8 94 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms