RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 KIAA0513O60268 411 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF17P17021 662 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ADH6P28332 368 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SQLEQ14534 574 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 GPR68Q15743 365 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 COX20Q5RI15 118 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 NAXEQ8NCW5 288 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 GPR119Q8TDV5 335 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 WNT2BQ93097 391 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ZG16BQ96DA0 208 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ARSGQ96EG1 525 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TRIB1Q96RU8 372 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 UCK2Q9BZX2 261 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 MED17Q9NVC6 651 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 WDR45Q9Y484 360 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 HCFC1P51610 2035 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 MAST4O15021 2626 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF264O43296 627 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 OIP5O43482 229 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TNFRSF21O75509 655 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 RCBTB2O95199 551 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 IL2RAP01589 272 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CD1EP15812 388 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CHRNEQ04844 493 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SRYQ05066 204 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 MAPK11Q15759 364 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 MAPK14Q16539 360 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SYPL1Q16563 259 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 RAET1LQ5VY80 246 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF787Q6DD87 383 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 POC1BQ8TC44 478 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SPDL1Q96EA4 605 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 NPAS1Q99742 590 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 LAT2Q9GZY6 243 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 NPHS2Q9NP85 383 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 VDAC3Q9Y277 283 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 A0A096LPI6 279 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 A0A1W2PP18 115 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CLCA1A8K7I4 914 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 H6PDO95479 791 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ANP32DO95626 131 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TFPTP0C1Z6 253 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 IGFBP2P18065 325 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 PGM1P36871 562 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF136P52737 540 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CLDN20P56880 219 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 RAC1P63000 192 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 FGFBP1Q14512 234 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 GGNQ86UU5 652 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 MEIOBQ8N635 442 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ANKFN1Q8N957 763 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 OR5W2Q8NH69 310 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TSPEARQ8WU66 669 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 DOCK7Q96N67 2140 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TM9SF2Q99805 663 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms