RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 UBQLNLQ8IYU4 475 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5M1Q8NGP8 315 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 STON2Q8WXE9 905 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 WNT2BQ93097 391 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ROPN1LQ96C74 230 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC46Q96FV0 321 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 UCN2Q96RP3 112 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SIKE1Q9BRV8 207 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 UCK2Q9BZX2 261 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 MED17Q9NVC6 651 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 MKLN1Q9UL63 735 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 LIPT1Q9Y234 373 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF337Q9Y3M9 751 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 C7orf72A4D263 438 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SERINC4A6NH21 518 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 C19orf84I3L1E1 186 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 HMGN4O00479 90 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF264O43296 627 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SEC14L5O43304 696 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA0513O60268 411 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 EDF1O60869 148 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TNFRSF21O75509 655 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 BMP5P22003 454 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ME2P23368 584 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF1P41567 113 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF141Q15928 474 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM44Q2T9K0 475 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 PLPPR5Q32ZL2 321 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 P4HA3Q7Z4N8 544 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF619Q8N2I2 560 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SMPDL3BQ92485 455 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 VPS33AQ96AX1 596 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 RABEP2Q9H5N1 569 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM45AQ9NWC5 275 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 CLCF1Q9UBD9 225 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 CARD8Q9Y2G2 431 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ENO4A6NNW6 628 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SHISA8B8ZZ34 492 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 FCMRO60667 390 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 UGT2B17O75795 530 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 CTSSP25774 331 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 OPRM1P35372 400 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP4BP51164 291 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 CCR4P51679 360 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF136P52737 540 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TFF3Q07654 80 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SQLEQ14534 574 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 LIX1LQ8IVB5 337 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 C9orf106Q8NAJ2 232 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 NAXEQ8NCW5 288 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 RFWD2Q8NHY2 731 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFP90Q8TF47 636 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF145Q96MT1 663 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SAP130Q9H0E3 1048 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ENKD1Q9H0I2 346 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 RAD21L1Q9H4I0 556 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TPT1P8Q9HAU6 139 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 NPHS2Q9NP85 383 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 MED4Q9NPJ6 270 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC167Q9P0B6 97 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 DCTN4Q9UJW0 460 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ICAM5Q9UMF0 924 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 MPDZO75970 2070 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC22A20A6NK97 555 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 NR5A2O00482 541 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 RCBTB2O95199 551 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 H6PDO95479 791 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 IL18BPO95998 194 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 CSTAP01040 98 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 NR2F1P10589 423 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ADH6P28332 368 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 CRATP43155 626 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ASCL1P50553 236 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 CLDN20P56880 219 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 RAC1P63000 192 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms