RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 NME2P1O60361 137 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 FMO6PO60774 539 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP7B1O75881 506 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 IFNW1P05000 195 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 RAP2AP10114 183 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 SFTPCP11686 197 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 NME2P22392 152 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC7A1P30825 629 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 IFNA8P32881 189 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 P2RX1P51575 399 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 COPZ1P61923 177 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNAB2Q13303 367 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CCNIQ14094 377 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 NRF1Q16656 503 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 BICRALQ6AI39 1079 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CARM1Q86X55 608 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5W2Q8NH69 310 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 STMN2Q93045 179 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 NTNG2Q96CW9 530 aa8.58□□□□□ -1.04
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SH3BP4-208ENST00000462602 SCMH1Q96GD3 660 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF597Q96LX8 424 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 SEPHS2Q99611 448 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 PROK2Q9HC23 129 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHL1Q9NR64 748 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 RLIMQ9NVW2 624 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 V9GYQ6 96 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R3H8 397 aa8.57□□□□□ -1.04
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SH3BP4-208ENST00000462602 PEX1O43933 1283 aa8.57□□□□□ -1.04
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SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CBR3O75828 277 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 EPPINO95925 133 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 FABP3P05413 133 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 LINGO3P0C6S8 592 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 PGCP20142 388 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 OR1E2P47887 323 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 ERFP50548 548 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CCR4P51679 360 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF117Q03924 483 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 EPS8Q12929 822 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 SKP2Q13309 424 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CBFBQ13951 182 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00303Q3SY05 128 aa8.57□□□□□ -1.04
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SH3BP4-208ENST00000462602 AAGABQ6PD74 315 aa8.57□□□□□ -1.04
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SH3BP4-208ENST00000462602 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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SH3BP4-208ENST00000462602 SULF2Q8IWU5 870 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2M7Q8NG81 312 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 NR4A3Q92570 626 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 ARSGQ96EG1 525 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF347Q96SE7 839 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF559Q9BR84 538 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 CHID1Q9BWS9 393 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-208ENST00000462602 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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