RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R41P59536 307 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NCS1P62166 190 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GPLD1P80108 840 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HSD11B2P80365 405 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SERTAD2Q14140 314 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ERV3-1Q14264 604 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KCNAB1Q14722 419 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GRM7Q14831 915 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR1Q1Q15612 314 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GPR68Q15743 365 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TIGD6Q17RP2 521 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PGGHGQ32M88 737 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL26Q53HC5 615 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C3orf38Q5JPI3 329 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 WDR45BQ5MNZ6 344 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PMS2CLQ68D20 193 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 QSOX2Q6ZRP7 698 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 COX15Q7KZN9 410 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NRMQ8IXM6 262 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CMIPQ8IY22 773 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PROKR2Q8NFJ6 384 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR7G1Q8NGA0 311 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR51Q1Q8NH59 317 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GPR151Q8TDV0 419 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SAP25Q8TEE9 199 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RNF138Q8WVD3 245 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RIT1Q92963 219 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LGALS12Q96DT0 336 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PEX11GQ96HA9 241 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 Q96MT0 163 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TGM7Q96PF1 710 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TIMP4Q99727 224 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF559Q9BR84 538 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 UBQLN3Q9H347 655 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PALMDQ9NP74 551 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CUTCQ9NTM9 273 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL28Q9NXS3 571 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NLGN3Q9NZ94 848 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CNIH4Q9P003 139 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GMEB2Q9UKD1 530 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FRYLO94915 3013 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM129A0AVI4 362 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 METTL15A6NJ78 407 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 EFCAB7A8K855 629 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PRODHO43272 600 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OIP5O43482 229 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CHP2O43745 196 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DUX1O43812 170 aa5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms