RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNEQ86WN2 208 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF130Q86XS8 419 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKFN1Q8N957 763 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP90Q8TF47 636 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FIG4Q92562 907 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2H4Q92759 462 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 NEURL3Q96EH8 262 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRG7Q96K78 797 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEB18Q96M61 343 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SFXN2Q96NB2 322 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52E6Q96RD3 313 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 RUBCNLQ9H714 662 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MED17Q9NVC6 651 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 DKKL1Q9UK85 242 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS13CQ709C8 3753 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TACC2O95359 2948 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA4P78363 2273 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0J9YW62 118 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BML4 177 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ST8SIA5O15466 376 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HCRTR2O43614 444 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 LINGO3P0C6S8 592 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ETFAP13804 333 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 NID1P14543 1247 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 CAPN3P20807 821 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MSX1P28360 303 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMP3P35625 211 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 UCN2Q96RP3 112 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.31□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 AKAP6Q13023 2319 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM234BA2RU67 622 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SERINC4A6NH21 518 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 H0Y3Z8 333 aa6.3□□□□□ -1.4
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