RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 GOLGA8RI6L899 631 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 AKAP10O43572 662 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 GPRIN2O60269 458 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 ALOX5P09917 674 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 IMPDH1P20839 514 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 ADH6P28332 368 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 PRKAA2P54646 552 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 PPA1Q15181 289 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 CCNJQ5T5M9 372 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 ZAR1Q86SH2 424 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 MISPQ8IVT2 679 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF614Q8N883 585 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 OR4C3Q8NH37 302 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 POC1BQ8TC44 478 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 FMO2Q99518 471 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 KLHDC3Q9BQ90 382 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM2Q9C040 744 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 GIN1Q9NXP7 522 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 POU2F3Q9UKI9 436 aa9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
DDX39B-211ENST00000449757 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 FAM234BA2RU67 622 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 DPRXA6NFQ7 191 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ABCD4O14678 606 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 RAMP1O60894 148 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SEC22BO75396 215 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 PRKD3O94806 890 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 KCNK2O95069 426 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 NKX2-2O95096 273 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 NGFRP08138 427 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 FAM157CP0CG43 387 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 NPIPA8P0DM63 369 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ATP6V1C1P21283 382 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ELK4P28324 431 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SLC7A1P30825 629 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CCR4P51679 360 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CASP9P55211 416 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF117Q03924 483 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ITGADQ13349 1161 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CD226Q15762 336 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 NRF1Q16656 503 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 DUSP5Q16690 384 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 NOXRED1Q6NXP6 359 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 TDRPQ86YL5 185 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 FBXO27Q8NI29 283 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZFP90Q8TF47 636 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 HTRA1Q92743 480 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 PPCDCQ96CD2 204 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 MUCL1Q96DR8 90 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 KCNK17Q96T54 332 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 BEX2Q9BXY8 128 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 FUT8Q9BYC5 575 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 PRSS50Q9UI38 385 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.14□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SHISA9B4DS77 424 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 C9JVG2 144 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF195O14628 629 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 YES1P07947 543 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 MYL2P10916 166 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 PYGBP11216 843 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms