RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448103.5

CASP12-208, Transcript of caspase 12 (gene/pseudogene), human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP12, Length 1,071 nt, Biotype polymorphic pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP12-208	ENST00000448103	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	LRR1	Q96L50	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	NPY6R	Q99463	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	CD5L	O43866	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	HSF2BP	O75031	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	HP	P00738	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	CA4	P22748	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	SLC6A6	P31641	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	RAD52	P43351	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	CDR2	Q01850	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	TNK1	Q13470	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	NRTN	Q99748	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	VPS18	Q9P253	973 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	DSCAM	O60469	2012 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	OR2B3	O76000	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	CLPTM1	O96005	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	HBQ1	P09105	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ZNF24	P17028	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ZNF75D	P51815	510 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	HSPB3	Q12988	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	P2RY6	Q15077	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	COX15	Q7KZN9	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	OOSP2	Q86WS3	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	DHX58	Q96C10	678 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CASP12-208	ENST00000448103	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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