RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 BDH1Q02338 343 aa14.84□□□□□ -0.03
SHQ1-202ENST00000444040 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.84□□□□□ -0.03
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SHQ1-202ENST00000444040 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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SHQ1-202ENST00000444040 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
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SHQ1-202ENST00000444040 RNF32Q9H0A6 362 aa14.84□□□□□ -0.03
SHQ1-202ENST00000444040 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.84□□□□□ -0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF221Q9UK13 617 aa14.84□□□□□ -0.03
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SHQ1-202ENST00000444040 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.83□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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SHQ1-202ENST00000444040 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.83□□□□□ -0.04
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SHQ1-202ENST00000444040 TMEM165Q9HC07 324 aa14.83□□□□□ -0.04
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SHQ1-202ENST00000444040 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.83□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.83□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 A0A0J9YY10 115 aa14.82□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 RNF13O43567 381 aa14.82□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 HCRTR1O43613 425 aa14.82□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 RFPL3O75679 317 aa14.82□□□□□ -0.04
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