RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429174.6

DYSF-211, Transcript of dysferlin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene DYSF, Length 6,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-211ENST00000429174 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.76□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.76□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PRAMEF2O60811 474 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 VIPR2P41587 438 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 RAB31Q13636 194 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 APOOLQ6UXV4 268 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 SPARTQ8N0X7 666 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 OR4K15Q8NH41 348 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PROX2Q3B8N5 592 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 KIAA0895LQ68EN5 471 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ZFP82Q8N141 532 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ITGB2P05107 769 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CSF1P09603 554 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 BCL7AQ4VC05 210 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 TMEM135Q86UB9 458 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 NDUFB2O95178 105 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 BMP2P12643 396 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 GPR19Q15760 415 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 E7ESA3 106 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 TXNDC12O95881 172 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 GALEQ14376 348 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 LPAL2Q16609 132 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.75□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 FADS1O60427 444 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CST6Q15828 149 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 LMO3Q8TAP4 145 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 A0A0B4J2A0 478 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 C17orf105B2RV13 164 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 SYPP08247 313 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 OMGP23515 440 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CLDN6P56747 220 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CCNJQ5T5M9 372 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 GABRQQ9UN88 632 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ABCC6O95255 1503 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 VRK2Q86Y07 508 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 TMEM25Q86YD3 366 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 TMEM239Q8WW34 195 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 BTBD2Q9BX70 525 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 MED20Q9H944 212 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ERV3-1Q14264 604 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 STEAP4Q687X5 459 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 COX15Q7KZN9 410 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 SULF2Q8IWU5 870 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 POLHQ9Y253 713 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 A0A1W2PQ09 198 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CDC14CA4D256 554 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 KLHL33A6NCF5 533 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 GPR37L1O60883 481 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 GPR148Q8TDV2 347 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PPA2Q9H2U2 334 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 SULT1C2O00338 296 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PCYT2Q99447 389 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 PINK1Q9BXM7 581 aa14.74□□□□□ -0.05
DYSF-211ENST00000429174 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms