RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 BMP7P18075 431 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 DDOSTP39656 456 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 TGM4P49221 684 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 OR1Q1Q15612 314 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 NDUFA5Q16718 116 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CPOQ8IVL8 374 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 POU2F3Q9UKI9 436 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 HMX3A6NHT5 357 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 H0YGG7 62 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 GABRPO00591 440 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 PAICSP22234 425 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V1E1P36543 226 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 TRAM1Q15629 374 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 GPR68Q15743 365 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ZSWIM7Q19AV6 140 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 GARNL3Q5VVW2 1013 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 NIPAL3Q6P499 406 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 GALNT12Q8IXK2 581 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 COX18Q8N8Q8 333 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SLC35B4Q969S0 331 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CTHRC1Q96CG8 243 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SNX18Q96RF0 628 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ZNF559Q9BR84 538 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 KCNN2Q9H2S1 579 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 OR6C74A6NCV1 312 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 LRRC72A6NJI9 287 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 HTR2AP28223 471 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 GPR18Q14330 331 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 MAPK14Q16539 360 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 EOGTQ5NDL2 527 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SHFQ7M4L6 423 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 RD3Q7Z3Z2 195 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 OR4N5Q8IXE1 308 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 VWA5B2Q8N398 1253 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 FANK1Q8TC84 345 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SHDQ96IW2 340 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 DEPDC7Q96QD5 511 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 OR2B2Q9GZK3 357 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 NEK6Q9HC98 313 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CMC2Q9NRP2 79 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 BABAM2Q9NXR7 383 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 OR5K4A6NMS3 321 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 BRINP1O60477 761 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 RASGRP1O95267 797 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 NTN1O95631 604 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CELP19835 753 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 TBXA2RP21731 343 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 AKT2P31751 481 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CD79BP40259 229 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 MTNR1BP49286 362 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 EVX1P49640 407 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 MGAT2Q10469 447 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CARTPTQ16568 116 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ALG11Q2TAA5 492 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 MARCH9Q86YJ5 346 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SYT14Q8NB59 555 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 NEIL3Q8TAT5 605 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SLC2A12Q8TD20 617 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 NEDD4LQ96PU5 975 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ATF6BQ99941 703 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CCDC182A6NF36 153 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A31A6NKX4 558 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 C10orf142B7Z368 130 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 RGS13O14921 159 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SLC19A2O60779 497 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 NKX2-2O95096 273 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 DRD5P21918 477 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 LCN1P1Q5VSP4 162 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 BBS1Q8NFJ9 593 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ADAP2Q9NPF8 381 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 MAT2BQ9NZL9 334 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 MED31Q9Y3C7 131 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms