RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409435.5

SCN9A-202, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 9, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN9A, Length 5,967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9A-202ENST00000409435 WASF3Q9UPY6 502 aa6.86□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF175Q9Y473 711 aa6.86□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 A8MXE2 369 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 LRRN3E7EW58 273 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ANHXE9PGG2 379 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 H0YGG7 62 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 SLC22A3O75751 556 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 CDK1P06493 297 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF20P17024 532 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 MAP2K3P46734 347 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 LSSP48449 732 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 KCNAB2Q13303 367 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 IHHQ14623 411 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 MANEALQ5VSG8 457 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ELP2Q6IA86 826 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 NIPAL3Q6P499 406 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 SPRED2Q7Z698 418 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 BIRC8Q96P09 236 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 TIMM22Q9Y584 194 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ADAMTS3O15072 1205 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 TO15178 435 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 AK1P00568 194 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 MAKP20794 623 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ARFRP1Q13795 201 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 NPY5RQ15761 445 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 CUZD1Q86UP6 607 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 UEVLDQ8IX04 471 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 LPGAT1Q92604 370 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ESAMQ96AP7 390 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 GABRG3Q99928 467 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 CHST11Q9NPF2 352 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 IL37Q9NZH6 218 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 MYH8P13535 1937 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 SHBGP04278 402 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 MMP12P39900 470 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 CAPZBP47756 277 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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SCN9A-202ENST00000409435 KLF10Q13118 480 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 FGFBP1Q14512 234 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 LIPJQ5W064 366 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 CNTD1Q8N815 330 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 OR56A3Q8NH54 315 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 PKP4Q99569 1192 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 UCK2Q9BZX2 261 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 IFT22Q9H7X7 185 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 VDAC3Q9Y277 283 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 A0A1W2PPH5 198 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 SCELO95171 688 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 MMP2P08253 660 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 BTN1A1Q13410 526 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 GUK1Q16774 197 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 RAB41Q5JT25 222 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 IL23RQ5VWK5 629 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 OR2A2Q6IF42 318 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 XKR5Q6UX68 686 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 TRIB3Q96RU7 358 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 SLC29A1Q99808 456 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 CALHM2Q9HA72 323 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 EPHA5P54756 1037 aa6.85□□□□□ -1.31
SCN9A-202ENST00000409435 PLGLAQ15195 96 aa6.85□□□□□ -1.31
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