RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PTTG1O95997 202 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 MELKQ14680 651 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 AWAT2Q6E213 333 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PLPP6Q8IY26 295 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 INTS14Q96SY0 518 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CDH20Q9HBT6 801 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 UGT2B7P16662 529 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FGL2Q14314 439 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 COQ8AQ8NI60 647 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 AGTR1P30556 359 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PTGER1P34995 402 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PRSS3P35030 304 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HOXC5Q00444 222 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TNFRSF17Q02223 184 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FGL1Q08830 312 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 BCL7AQ4VC05 210 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 CCNJQ5T5M9 372 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 OPN5Q6U736 354 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GATA6Q92908 595 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ISL2Q96A47 359 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 AGAP5A6NIR3 686 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SOX3P41225 446 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ECH1Q13011 328 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PGGHGQ32M88 737 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC6A19Q695T7 634 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RETREG3Q86VR2 466 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 VRK2Q86Y07 508 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 LCATP04180 440 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ERVK-25P63136 954 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PTPRRQ15256 657 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 OR1Q1Q15612 314 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 HES5Q5TA89 166 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 Q6ZSR9 355 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TM9SF4Q92544 642 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 NUP50Q9UKX7 468 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 H3BMQ9 156 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 SLCO2B1O94956 709 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 MLC1Q15049 377 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 OR7A5Q15622 319 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 COG8Q96MW5 612 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF175Q9Y473 711 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 REEP5Q00765 189 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 CDKN3Q16667 212 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM163Q8TC26 289 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 NLKQ9UBE8 527 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 IL7P13232 177 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 MS4A8Q9BY19 250 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 M0R036 132 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 EGFP01133 1207 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 AMY2AP04746 511 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 CHMP24386 653 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 GIPRP48546 466 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 SELPLGQ14242 412 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 BEST3Q8N1M1 668 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 LMF1Q96S06 567 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 SYT3Q9BQG1 590 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 IDUAP35475 653 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF691Q5VV52 312 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms