RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 BLACEA4D250 179 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM20BO75063 409 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 IFI6P09912 130 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 MYF5P13349 255 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 HOXA6P31267 233 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 IDUAP35475 653 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TAS2R41P59536 307 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CSNK2BP67870 215 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 FOXK2Q01167 660 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ERV3-1Q14264 604 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GRM7Q14831 915 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR68Q15743 365 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ARSKQ6UWY0 536 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 STACQ99469 402 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGDIGQ99819 225 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 UCK2Q9BZX2 261 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF350Q9GZX5 532 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CAPN10Q9HC96 672 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 IMPAD1Q9NX62 359 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SPATA2Q9UM82 520 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 FITM1A5D6W6 292 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 HMX3A6NHT5 357 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 HRO43593 1189 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 DYRK3O43781 588 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CTNSO60931 367 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 STX11O75558 287 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2B3O76000 313 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CBX7O95931 251 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GIMD1P0DJR0 217 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CHMP24386 653 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 POU1F1P28069 291 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR3P46089 330 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 HSD11B2P80365 405 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 BNC1Q01954 994 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 XAF1Q6GPH4 301 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PODNL1Q6PEZ8 512 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 APH1BQ8WW43 257 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 RIT1Q92963 219 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PHF21AQ96BD5 680 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 FUZQ9BT04 418 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CHST2Q9Y4C5 530 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SEC16AO15027 2179 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PPW3 197 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 H0YIG0 161 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 AP3D1O14617 1153 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SERPINI2O75830 405 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 AK1P00568 194 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 IFNA16P05015 189 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 RAC2P15153 192 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CSF2RBP32927 897 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GABRA3P34903 492 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 HTR2BP41595 481 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GDI2P50395 445 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CRISP1P54107 249 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CDC42P60953 191 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC35A2P78381 396 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 BTG2P78543 158 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZXDAP98168 799 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CFHR1Q03591 330 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 MAP4K2Q12851 820 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SHBQ15464 509 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 EIPR1Q53HC9 387 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PMS2CLQ68D20 193 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CARFQ8N187 725 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00471Q8N535 108 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms