RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 ATP6V0D1P61421 351 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 ITGADQ13349 1161 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 TAB1Q15750 504 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 ZNF544Q6NX49 715 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 LAS2Q8IYD9 372 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 CEP112Q8N8E3 955 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 NEUROG1Q92886 237 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 CERS2Q96G23 380 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 ITPAQ9BY32 194 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 DERL2Q9GZP9 239 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 FKRPQ9H9S5 495 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 SENP1Q9P0U3 644 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 OPTCQ9UBM4 332 aa6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 GJE1A6NN92 205 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 VSTM5A8MXK1 200 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 FAM157AC9JC47 383 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 H7C417 338 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 PLPP1O14494 284 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 TO15178 435 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 SCO2O43819 266 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 AQP8O94778 261 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 PTAFRP25105 342 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 EVI2BP34910 448 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 PTGDSP41222 190 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 LIMS1P48059 325 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 CLDN20P56880 219 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 CARD18P57730 90 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 STX5Q13190 355 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 CUL3Q13618 768 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 LGSNQ5TDP6 509 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 HIPK4Q8NE63 616 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 SLC35A4Q96G79 324 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 SERPINI1Q99574 410 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 FOXB1Q99853 325 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 MYNNQ9NPC7 610 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 NFU1Q9UMS0 254 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 ASB4Q9Y574 426 aa6.97□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.96□□□□□ -1.29
CASP4-201ENST00000393150 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 A0A087WZY1 265 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 A0A096LNT2 108 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 A0A0A6YYD5 115 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 C1orf226A1L170 272 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 DPRXA6NFQ7 191 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 K7EPI3 171 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 PGRMC2O15173 223 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 RAMP1O60894 148 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 ESRRBO95718 433 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 ADAP00813 363 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 CLPSP04118 112 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 GGT1P19440 569 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 GABRB3P28472 473 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 NR4A2P43354 598 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 CHN2P52757 468 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 MAPK12P53778 367 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 ZNF844Q08AG5 666 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.96□□□□□ -1.3
CASP4-201ENST00000393150 GUSBP1Q15486 140 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms