RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC17Q8N6Y2 441 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 KCT2Q8NC54 265 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR4E2Q8NGC2 313 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR4Q3Q8NH05 313 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR14C36Q8NHC7 312 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 NR4A3Q92570 626 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLC35A4Q96G79 324 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 FCRL4Q96PJ5 515 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MED18Q9BUE0 208 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ISYNA1Q9NPH2 558 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ATG2BQ96BY7 2078 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 LALBAP00709 142 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RRASP10301 218 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CELP19835 753 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 C5AR1P21730 350 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 STAT5AP42229 794 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 HDDC2Q7Z4H3 204 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MRGPREQ86SM8 312 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 NRROSQ86YC3 692 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MFSD9Q8NBP5 474 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MARC2Q969Z3 335 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ARMC5Q96C12 935 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLC41A3Q96GZ6 507 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SORCS2Q96PQ0 1159 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 FOLH1BQ9HBA9 442 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CHST2Q9Y4C5 530 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1W2PQU0 124 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SURF4O15260 269 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PIP5K1CO60331 668 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLC2A10O95528 541 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ADH1BP00325 375 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CFDP00746 253 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 HK1P19367 917 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 EVX1P49640 407 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF81P51508 661 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SEC13P55735 322 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GPR176Q14439 515 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 COL28A1Q2UY09 1125 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GDF7Q7Z4P5 450 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ADGRG3Q86Y34 549 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MARCH9Q86YJ5 346 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 YAF2Q8IY57 180 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLC16A11Q8NCK7 471 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 BBS1Q8NFJ9 593 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM255BQ8WV15 326 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CDS1Q92903 461 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF681Q96N22 645 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RBP7Q96R05 134 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 UBQLN2Q9UHD9 624 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TRAV6A0A075B6T7 132 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 SGK494L7N484 410 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 IFNA7P01567 189 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 SYPP08247 313 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 CXCL3P19876 107 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 RPS21P63220 83 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 DSG2Q14126 1118 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 DECR1Q16698 335 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 CFAP77Q6ZQR2 320 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 ASB18Q6ZVZ8 466 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 TRILQ7L0X0 811 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 OR4N5Q8IXE1 308 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL36Q8N4N3 616 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 LCN9Q8WX39 176 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL15Q96M94 604 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 ATF6BQ99941 703 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 SLC17A9Q9BYT1 436 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 HDHD2Q9H0R4 259 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 DUXAA6NLW8 204 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 SLC31A1O15431 190 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 LANCL1O43813 399 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 PAHP00439 452 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 APODP05090 189 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 POU2F2P09086 479 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 FPR3P25089 353 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 STOMP27105 288 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 PRKAR1BP31321 381 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 CLDN2P57739 230 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 AGERQ15109 404 aa12.27□□□□□ -0.45
TMOD1-202ENST00000375175 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms