RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 UGT8Q16880 541 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CDNFQ49AH0 187 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SDSLQ96GA7 329 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR52B2Q96RD2 323 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NUDT9Q9BW91 350 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR2M5A3KFT3 312 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LRRN3E7EW58 273 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CDRT1O95170 752 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 DBHP09172 617 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 INHBCP55103 352 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TAS2R30P59541 319 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RAB6CQ53S08 254 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LILRB2Q8N423 598 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SCRN2Q96FV2 425 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RNF6Q9Y252 685 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SULT2B1O00204 365 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ANKRD28O15084 1053 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 AQP9O43315 295 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GABRR1P24046 479 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 STC1P52823 247 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ERVK-16P61578 105 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ACTA2P62736 377 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ACTG2P63267 376 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ACTC1P68032 377 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ACTA1P68133 377 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 HSF1Q00613 529 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RAB33AQ14088 237 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 KCNAB1Q14722 419 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 Q7L0L9 218 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 BATF2Q8N1L9 274 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NELL2Q99435 816 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CMAHPQ9Y471 501 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 EMC8O43402 210 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SC5DO75845 299 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MT-ND2P03891 347 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 UQCRFS1P47985 274 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PTTG1IPP53801 180 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ARSFP54793 590 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 HES1Q14469 280 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MSS51Q4VC12 460 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RNF175Q8N4F7 328 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LMF1Q96S06 567 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FKRPQ9H9S5 495 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SIX2Q9NPC8 291 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TO15178 435 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PPP1R3DO95685 299 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM225BP0DP42 221 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PEX2P28328 305 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 XCR1P46094 333 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LIPJQ5W064 366 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PNCKQ6P2M8 343 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NAA40Q86UY6 237 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ROPN1LQ96C74 230 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LRCH3Q96II8 777 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms