RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 UCK2Q9BZX2 261 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 DNAI2Q9GZS0 605 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 POPDC2Q9HBU9 364 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TUFT1Q9NNX1 390 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 GDE1Q9NZC3 331 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 NYAP2Q9P242 653 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CTSFQ9UBX1 484 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ANAPC7Q9UJX3 599 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RARRES3Q9UL19 164 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 DNPEPQ9ULA0 475 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 STAP1Q9ULZ2 295 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 COQ4Q9Y3A0 265 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 U3KQ87 197 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PHIPQ8WWQ0 1821 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 LOC100653049A0A140TA62 436 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PRQ8 180 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CIB4A0PJX0 185 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 OR2A25A4D2G3 310 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 KRT87PA6NCN2 255 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TRABD2BA6NFA1 517 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 EFCAB7A8K855 629 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 A8MUA0 341 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 B4DXG7 233 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 KRBOX1C9JBD0 128 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 I3L521 148 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 FXYD1O00168 92 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SLC1A7O00341 560 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 E2F3O00716 465 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 EI24O14681 340 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 AIM2O14862 343 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SLC30A4O14863 429 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CHADO15335 359 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 STX7O15400 261 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 KCNN4O15554 427 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 AKR7A2O43488 359 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 B4GAT1O43505 415 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 BCL2L11O43521 198 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CALUO43852 315 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 BANF1O75531 89 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZMPSTE24O75844 475 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RBBP9O75884 186 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 KRT34O76011 436 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 APOA1P02647 267 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 IL6P05231 212 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 FABP1P07148 127 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM49P0CI25 452 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM49CP0CI26 452 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CSH1P0DML2 217 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CSH2P0DML3 217 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 LIFP15018 202 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SPI1P17947 270 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 FASP25445 335 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PSMA2P25787 234 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ELK4P28324 431 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ACSL1P33121 698 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RPL22P35268 128 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 HNF4AP41235 474 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SLC15A1P46059 708 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 NSFP46459 744 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 P2RY4P51582 365 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ALDH3A2P51648 485 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RAB25P57735 213 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 MYL6P60660 151 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SNAP25P60880 206 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RAB14P61106 215 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 AP1S1P61966 158 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CCNA1P78396 465 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 KCNJ10P78508 379 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 DHODHQ02127 395 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CD47Q08722 323 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 EPS8Q12929 822 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 MAMLD1Q13495 774 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PON2Q15165 354 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ANGPT1Q15389 498 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 MAPK11Q15759 364 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF79Q15937 498 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TAF12Q16514 161 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms