RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CCNJQ5T5M9 372 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CDC73Q6P1J9 531 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MEIOBQ8N635 442 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GATSQ8NAP1 163 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR4C3Q8NH37 302 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FAM110BQ8TC76 370 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 STACQ99469 402 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PIGQQ9BRB3 760 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 BTBD2Q9BX70 525 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RMND5AQ9H871 391 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 AKAP6Q13023 2319 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WZY1 265 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SCDO00767 359 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RCBTB2O95199 551 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TGM6O95932 706 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 AGR2O95994 175 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF17P17021 662 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V1C1P21283 382 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CPA2P48052 419 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 IDH3AP50213 366 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MMP16P51512 607 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN20P56880 219 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 HBA1P69905 142 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SQLEQ14534 574 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DCST2Q5T1A1 773 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR2A2Q6IF42 318 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 KIF18BQ86Y91 864 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MISPQ8IVT2 679 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SMPDL3BQ92485 455 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PIGUQ9H490 435 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GIN1Q9NXP7 522 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 JKAMPQ9P055 326 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 VDAC3Q9Y277 283 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MTORP42345 2549 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZANQ9Y493 2812 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MPDZO75970 2070 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0G2JND7 137 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PNV4 684 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PQD3 144 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FAM234BA2RU67 622 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C7orf72A4D263 438 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DUXAA6NLW8 204 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 H0YC42 278 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF195O14628 629 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD28O15084 1053 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 AK1P00568 194 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PGRP06401 933 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CRHP06850 196 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FCGR2AP12318 317 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CPOXP36551 454 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN15P56746 228 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SORDQ00796 357 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GUCY1A3Q02108 690 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF117Q03924 483 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CD226Q15762 336 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms