RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 MED20Q9H944 212 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 EBF1Q9UH73 591 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 ARPC5O15511 151 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 FEVQ99581 238 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 NKX3-2P78367 333 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TUBA3CQ13748 450 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 GINS3Q9BRX5 216 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 DCST2Q5T1A1 773 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 H7C1C5 153 aa9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 IL7P13232 177 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ARSBP15848 533 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 LCN6P62502 163 aa9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 SYT3Q9BQG1 590 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PRSS38A1L453 326 aa9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 CALCBP10092 127 aa9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 OR1J4Q8NGS1 313 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 HPGDSO60760 199 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CD46P15529 392 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FUT1P19526 365 aa9.94□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 SH3BP2P78314 561 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CDK3Q00526 305 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 COMMD7Q86VX2 200 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 C1orf74Q96LT6 269 aa9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ABCG5Q9H222 651 aa9.94□□□□□ -0.82
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