RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTSSP25774 331 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASCL1P50553 236 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLX5P56178 289 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC74AQ0VAA2 488 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFAF6Q330K2 333 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDZK1Q5T2W1 519 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBLN3Q6UW01 205 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf62Q7Z3J2 963 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGNQ86UU5 652 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF130Q86XS8 419 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF614Q8N883 585 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 POC1BQ8TC44 478 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 CKAP2Q8WWK9 683 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMPDL3BQ92485 455 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 EBF4Q9BQW3 602 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCF7L2Q9NQB0 619 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ICAM5Q9UMF0 924 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARD8Q9Y2G2 431 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP4B1Q9Y6B7 739 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEATR5AQ86XA9 2040 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BNH8 94 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGN4O00479 90 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA0513O60268 411 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCBTB2O95199 551 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL18BPO95998 194 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINGO3P0C6S8 592 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 IDH3AP50213 366 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR68Q15743 365 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF141Q15928 474 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIER2Q8N344 545 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL25Q8N6Q8 603 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIML2Q8N7C3 387 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 XAGE5Q8WWM1 108 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF145Q96MT1 663 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP3Q96NJ6 502 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A13Q9NSD5 602 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 MKLN1Q9UL63 735 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSMD1Q96PZ7 3565 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERINC4A6NH21 518 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT2B17O75795 530 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 GUSBP08236 651 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBL4AP11441 157 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPRM1P35372 400 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RX1P51575 399 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP5P55064 265 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXF1Q12946 379 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIGD2Q4W5G0 525 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATAD3BQ5T9A4 648 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRRS1Q6ZNA5 592 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF621Q6ZSS3 439 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCNT2Q8N0V5 402 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 FIG4Q92562 907 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ROPN1LQ96C74 230 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 C14orf79Q96F83 325 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEB18Q96M61 343 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFXN3Q9BWM7 321 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 PINK1Q9BXM7 581 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF446Q9NWS9 450 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A20A6NK97 555 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFXANKO14593 260 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHMP1BQ7LBR1 199 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP90Q8TF47 636 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS33AQ96AX1 596 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF524Q96C55 264 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC28BQ9BUN5 200 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAP130Q9H0E3 1048 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLE3Q9NRF9 147 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 JKAMPQ9P055 326 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 L3MBTL1Q9Y468 752 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF175Q9Y473 711 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR45Q9Y484 360 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLQO75417 2590 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM234BA2RU67 622 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT5O00445 386 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF264O43296 627 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFSF13O75888 250 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL11P20809 199 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSTR2P30874 369 aa17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms